OKULUMUZ 2000 YILINDA MUŞ İLİNİN KIZILAĞAÇ BELDESİNDE KIZILAĞAÇ CUMHURİYET YATILI BÖLGE OKULU OLARAK EĞİTİM ÖĞRETİME BAŞLAMIŞTIR. KIZILAĞAÇ BELDESİNE BAĞLI CİVAR KÖYLERDEN GELEN 800 ÖĞRENCİ İLE EĞİTİM ÖĞRETİME DEVAM EDEN OKULUMUZDA 500 ÖĞRENCİ YATILI OLARAK EĞİTİM ALMIŞTIR. DAHA SONRA 2016-2017 EĞİTİM ÖĞRETİM YILINDA VALLİLİK KARARI İLE OKULUMUZ KIZILAĞAÇ İMAM HATİP ORTAOKULU OLARAK EĞİTİM-ÖĞRETİME DEVAM EDERKEN YATILI KISMI KAPATILARAK TAŞIMALI EĞİTİME GEÇİLMİŞTİR.